Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms