Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FgaE9PV24 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FgaE9PV24 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms