Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh8D3Z6W3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms