Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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