Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms