Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms