Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms