Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usf3B2RUQ2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usf3B2RUQ2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms