Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms