Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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