Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms