Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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