Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stxbp4Q9WV89 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms