Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Atp11cQ9QZW0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Atp11cQ9QZW0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Atp11cQ9QZW0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Atp11cQ9QZW0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Atp11cQ9QZW0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Atp11cQ9QZW0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms