Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms