Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms