Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chrac1Q9JKP8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms