Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ClpxQ9JHS4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ClpxQ9JHS4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms