Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms