Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim54Q9ERP3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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