Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cse1lQ9ERK4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms