Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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