Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms