Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms