Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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