Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chmp4cQ9D7F7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp4cQ9D7F7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms