Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc6bQ9D289 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Trappc6bQ9D289 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Trappc6bQ9D289 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
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