Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl53Q9D1H8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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