Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shmt2Q9CZN7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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