Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thumpd2Q9CZB3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms