Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Sgo1Q9CXH7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Sgo1Q9CXH7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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