Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ddx28Q9CWT6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ddx28Q9CWT6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddx28Q9CWT6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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