Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWB5

Pgpep1l, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1lQ9CWB5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pgpep1lQ9CWB5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms