Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms