Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prpf8Q99PV0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms