Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CalcbQ99MP3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms