Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp1b4Q99ME6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp1b4Q99ME6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms