Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms