Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn2aQ99KJ0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms