Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms