Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms