Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp3Q91W36 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp3Q91W36 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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