Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenomQ8VHC3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms