Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q8VDP2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q8VDP2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms