Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BbxQ8VBW5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms