Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc12Q8K2L8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms