Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Brd3Q8K2F0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd3Q8K2F0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms