Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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