Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Nhlrc3Q8CCH2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Nhlrc3Q8CCH2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Nhlrc3Q8CCH2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Nhlrc3Q8CCH2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Nhlrc3Q8CCH2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Nhlrc3Q8CCH2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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