Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SynpoQ8CC35 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SynpoQ8CC35 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms